Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Abcc1O35379 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc1O35379 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms