Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q1O19441 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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H2-Q1O19441 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q1O19441 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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