Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms