Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LfngO09010 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LfngO09010 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LfngO09010 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LfngO09010 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LfngO09010 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LfngO09010 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LfngO09010 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LfngO09010 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LfngO09010 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LfngO09010 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LfngO09010 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LfngO09010 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LfngO09010 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LfngO09010 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms