Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Flot1O08917 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Flot1O08917 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Flot1O08917 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Flot1O08917 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Flot1O08917 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Flot1O08917 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Flot1O08917 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flot1O08917 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Flot1O08917 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Flot1O08917 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Flot1O08917 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Flot1O08917 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Flot1O08917 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Flot1O08917 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Flot1O08917 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Flot1O08917 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Flot1O08917 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Flot1O08917 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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