Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CckarO08786 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckarO08786 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckarO08786 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckarO08786 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckarO08786 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckarO08786 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckarO08786 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CckarO08786 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckarO08786 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckarO08786 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckarO08786 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CckarO08786 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CckarO08786 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CckarO08786 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CckarO08786 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckarO08786 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CckarO08786 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckarO08786 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckarO08786 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CckarO08786 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CckarO08786 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CckarO08786 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CckarO08786 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CckarO08786 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CckarO08786 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CckarO08786 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CckarO08786 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CckarO08786 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms