Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Barx2O08686 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Barx2O08686 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms