Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm17078M0QW51 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17078M0QW51 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms