Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm21310J3QQ23 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm21310J3QQ23 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm21310J3QQ23 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21310J3QQ23 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm21310J3QQ23 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm21310J3QQ23 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm21310J3QQ23 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21310J3QQ23 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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