Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2035J3QP87 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2035J3QP87 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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