Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms