Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20918J3QN17 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20918J3QN17 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms