Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20873J3QMQ9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Gm20873J3QMQ9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20873J3QMQ9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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