Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lipo1J3QME6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lipo1J3QME6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 981.6 ms