Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21969J3QJZ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21969J3QJZ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms