Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AK157302I3ITR1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AK157302I3ITR1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms