Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3tc1G3X9F6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3tc1G3X9F6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms