Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc9a3G3X939 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms