Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34aG3UW52 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms