Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Ercc6F8VPZ5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ercc6F8VPZ5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms