Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Colca2F8VPY8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms