Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5218F6YH22 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms