Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5861F6VCN9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5861F6VCN9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms