Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm340F6RGI3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms