Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prl3d2F6R3P9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prl3d2F6R3P9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prl3d2F6R3P9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms