Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm29094F6Q785 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms