Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod3E9QA62 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lmod3E9QA62 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms