Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BC005561E9Q5E2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BC005561E9Q5E2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms