Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms