Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Catsperg1E9Q355 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsperg1E9Q355 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms