Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt90E9Q1Z0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Krt90E9Q1Z0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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