Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3893E9Q1I1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3893E9Q1I1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms