Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt78E9Q0F0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt78E9Q0F0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms