Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms