Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx60E9PZQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx60E9PZQ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
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