Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Brd1E9PZ26 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brd1E9PZ26 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brd1E9PZ26 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brd1E9PZ26 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brd1E9PZ26 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brd1E9PZ26 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd1E9PZ26 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd1E9PZ26 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd1E9PZ26 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brd1E9PZ26 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms