Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ2

Scgb1b20, ABPA20, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b20E9PWZ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b20E9PWZ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms