Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rsf1E9PWW9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rsf1E9PWW9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rsf1E9PWW9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rsf1E9PWW9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms