Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc62E9PVD1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc62E9PVD1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms