Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms