Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syde2E9PUP1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syde2E9PUP1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms