Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clca3bE9PUL3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clca3bE9PUL3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms