Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam46aD3Z5S8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms