Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm1330D3Z460 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm1330D3Z460 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms