Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc8D3YZV8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms