Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn24D3YXJ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms