Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC048679D3YXE9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms