Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clip3B9EHT4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms