Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr3aB2RXC6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr3aB2RXC6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms