Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap58B2RW38 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cfap58B2RW38 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms